Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUCB1Q02818 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUCB1Q02818 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms