Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms