Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms