Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDK5Q00535 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDK5Q00535 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK5Q00535 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK5Q00535 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK5Q00535 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK5Q00535 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK5Q00535 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK5Q00535 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK5Q00535 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK5Q00535 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK5Q00535 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK5Q00535 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK5Q00535 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK5Q00535 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK5Q00535 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK5Q00535 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDK5Q00535 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms