Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM193AP78312 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms