Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP1P63208 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP1P63208 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP1P63208 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP1P63208 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP1P63208 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP1P63208 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP1P63208 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP1P63208 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP1P63208 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP1P63208 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP1P63208 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP1P63208 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP1P63208 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKP1P63208 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKP1P63208 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKP1P63208 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms