Protein–RNA interactions for Protein: P58005

SESN3, Sestrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SESN3P58005 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SESN3P58005 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SESN3P58005 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SESN3P58005 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms