Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXW4P57775 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms