Protein–RNA interactions for Protein: P56645

PER3, Period circadian protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER3P56645 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PER3P56645 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PER3P56645 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PER3P56645 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PER3P56645 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PER3P56645 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PER3P56645 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PER3P56645 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PER3P56645 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PER3P56645 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PER3P56645 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PER3P56645 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PER3P56645 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PER3P56645 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PER3P56645 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PER3P56645 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PER3P56645 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PER3P56645 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PER3P56645 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms