Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCL1P53675 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCL1P53675 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCL1P53675 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCL1P53675 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCL1P53675 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCL1P53675 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCL1P53675 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCL1P53675 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCL1P53675 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCL1P53675 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCL1P53675 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCL1P53675 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCL1P53675 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCL1P53675 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTCL1P53675 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCL1P53675 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTCL1P53675 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms