Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB5CP51148 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms