Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA8P48165 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA8P48165 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA8P48165 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms