Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms