Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NBL1P41271 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NBL1P41271 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NBL1P41271 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NBL1P41271 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NBL1P41271 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NBL1P41271 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NBL1P41271 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NBL1P41271 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NBL1P41271 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NBL1P41271 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NBL1P41271 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms