Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETFBP38117 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ETFBP38117 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETFBP38117 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETFBP38117 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETFBP38117 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETFBP38117 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETFBP38117 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETFBP38117 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETFBP38117 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETFBP38117 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms