Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms