Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NFKBIAP25963 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms