Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRAFP15056 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRAFP15056 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BRAFP15056 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms