Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFTRP13569 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFTRP13569 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFTRP13569 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFTRP13569 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CFTRP13569 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CFTRP13569 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CFTRP13569 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFTRP13569 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFTRP13569 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFTRP13569 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFTRP13569 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFTRP13569 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFTRP13569 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFTRP13569 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFTRP13569 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFTRP13569 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFTRP13569 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFTRP13569 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFTRP13569 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CFTRP13569 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFTRP13569 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFTRP13569 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFTRP13569 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CFTRP13569 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFTRP13569 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFTRP13569 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CFTRP13569 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFTRP13569 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFTRP13569 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFTRP13569 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFTRP13569 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFTRP13569 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFTRP13569 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFTRP13569 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFTRP13569 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFTRP13569 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFTRP13569 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFTRP13569 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms