Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPBP07199 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms