Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APODP05090 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APODP05090 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APODP05090 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APODP05090 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms