Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFB1P01137 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms