Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EGFRP00533 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EGFRP00533 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EGFRP00533 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EGFRP00533 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EGFRP00533 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EGFRP00533 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EGFRP00533 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EGFRP00533 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EGFRP00533 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EGFRP00533 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EGFRP00533 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EGFRP00533 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EGFRP00533 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms