Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBXN7O94888 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN7O94888 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms