Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NPHP4O75161 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP4O75161 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms