Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXO3O43524 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms