Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF208O43345 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms