Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRTM2O43300 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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