Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBTB39O15060 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBTB39O15060 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBTB39O15060 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBTB39O15060 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBTB39O15060 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBTB39O15060 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBTB39O15060 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBTB39O15060 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBTB39O15060 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBTB39O15060 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBTB39O15060 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZBTB39O15060 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZBTB39O15060 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms