Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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