Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PATL2C9JE40 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms