Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms