Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L9A6NEM1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms