Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSDA5PKW4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms