Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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ARL2-SNX15V9GYD0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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ARL2-SNX15V9GYD0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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