Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINLQ9Y2I6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINLQ9Y2I6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms