Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF12

PRODH2, Hydroxyproline dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODH2Q9UF12 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRODH2Q9UF12 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms