Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLKQ9UBT6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms