Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL9Q9P2J3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms