Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms