Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PHRF1Q9P1Y6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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