Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNA2D2Q9NY47 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D2Q9NY47 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms