Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms