Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRHQ9HD43 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms