Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms