Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BCL11BQ9C0K0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms