Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms