Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP1-5Q9BYS1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms