Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC8Q9BY41 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms