Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms